建设项目的跟踪审计是依据法律法规对建设工程项目全过程的造价管理进行事前、事中、事后的咨询、鉴证和监督的活动；它对建设项目有计划的从可行性研究、立项、初步设计、施工图设计、施工、竣工结（决）算等诸多环节，进行审计监督的一种方法。为了规范审计行为，明确审计责任，提高审计质量，现根据审计法及其他有关审计法规的规定，结合建设工程跟踪审计自身特点，制定了跟踪审计质量控制制度。主要包括以下三个方面：
1 前期准备阶段质量控制
1.1业务承接质量控制。
（1）当业主方提出委托后，工程审核人员应对被审核单位及工程项目的基本情况充分了解，包括：业主方的意图、工程项目的性质、类别、规模、结算方式、材料供应方式、工程价款结算方式、委托前是否被审核过，审核所需资料的可获取性等。在考虑自身的专业能力和审核风险的基础上，由承接人报部门经理，部门经理报至项目技术负责人，或承接人告知部门经理后直接报至项目技术负责人，进行审批。
（2）当承接人了解到委托项目的上述情况中异常现象时，应重点提出，报部门经理至项目技术负责人，决定是否受托。
（3）由施工单位送审或代理建设单位送审的工程项目，审核人员除了解上述情况外，必须与业主方取得联系，核实有关情况，报部门经理至项目技术负责人，决定是否受托。
（4）经批准或同意受理委托后，应及时与委托人签订《工程造价咨询合同》。
1.2审前调查工作质量控制。
详细了解被审计项目的基本情况，分析调查资料，确定审计目标、审计形式和工作重点。重点了解下列内容：
（1）项目立项及可行性报告批准情况；
（2）项目概算或预算的批准与调整情况；
（3）年度预算安排情况；
（4）建设资金筹措计划与实际到位情况；
（5）基本建设程序执行情况；
（6）工程现场管理、工程财务核算、工程材料与设备管理、工程价款结算、工程合同管理等内部控制制度的建立情况。
2 项目实施阶段工程造价审核质量控制
审计实施过程的控制是提高审计质量的中心环节。在跟踪审计中，为了确保审计质量，降低审计风险，必须强化审计实施过程的控制。项目实施阶段的审计主要针对工程款使用、工程进度款的拨付、工程程变更及签证、工程费用索赔、材料与设备的询价等方面展开。在跟踪审计过程中，应重点抓住以下几个监控要点：
2.1核对标书预算，提出重点控制子项和控制方案。
2.2做好咨询日记，对重点控制子项和重点隐蔽项目进行抽查和摄像（必要时附照片）。
重点子项包括：
（1）预算书、设计图纸与实际不符合或不明确的分部分项工程；
（2）采用新材料、新构造、新工艺、新技术的分部分项工程；
（3）地基、基础、梁、柱、板等重要隐蔽工程处；
（4）采用的重要技术措施，包括安全措施和文明施工措施，赶工措施和其它重要措施；
（5）重要的机械设备、运输、装载和起重设备；
（6）月头和月尾的代表性进度标志；
（7）大宗材料和特殊材料的进场验收、包装、保管状况。
2.3涉及图纸、预算、合同等与实际情况不符处，均需填写现场审核签证书（必要时附照片）并经现场业主代表或监理工程师确认签证。
2.4审核施工单位已完工程月报，按时报送业主。
2.5编制咨询月报。
咨询月报内容：
（1）本月施工进度情况，与投标书进度的差异及原因分析。
（2）本月完成工程量和投资额情况，与计划工程量差异及原因分析。
（3）图纸变更情况汇总。
（4）本月其它重大事项。
（5）验工月报汇总单。
（6）合理化建议。
3 审计日记与工作底稿质量控制
3.1审计日记质量控制。
审计日记是审计人员以人为单位按时间顺序反映其每日实施审计全过程的书面记录。审计人员应当在实施审计过程中真实、完整地逐日编写审计日记。审计日记主要记载审计事项名称、步骤与方法、审计人员的专业判断和查证结果，做到要素齐全，内容完整，简明扼要。
3.2加强工作底稿的编制工作。
在审核工作结束后，一般项目应在2个工作日内整理好工作底稿、编写审核小结，重大项目应在7日内完成上述工作。审核小结一般由审核人员编写，并需经项目负责人及部门经理审核后报分管副总，复核有无遗漏事项或调整事项。对审计工作底稿的编制做好如下要求：
（1）结构完整，要素齐全。既有来审情况、审计过程记录、审计结论等内容，又有被审计单位名称、审计项目名称、编制人、复核人等要素。
（2）内容真实完整，重点突出。容观地反映被审计单位的情况以及审计方案的实施情况。
（3）观点明确，条理清楚。审计工作底稿所记载审计事项及其时间、地点、当事人、数据、计算方法以及审计人员对它的因果分析必须准确无误。
（4）手续完备，程序合法。审计工作底稿所附的证明材料，经被审计单位有关当事人或其它提供证明资料的人员签名盖章。
3.3建立严格的工作底稿复核制度。
（1）审计工作底稿四级复核制度。
对审计工作底稿的复核采取四级复核制度，审计工作底稿由项目负责人、部门负责人、技术负责人、总经理在审计实施过程中、审计报告形成前期进行复核。在复核时，各复核人员做好记录，书面表示复核意见并签名，以分清责任。审计组员应当根据实际情况，参考复核意见，时审计工作底稿进行补充、修改或作出说明。
四级复核制度的好处是；一是减少或消除人为审计误差，以降低审计风险，提高审计质量；二是及时发现和解决问题，保证审计方案顺利执行；三是协调审计进度，节约审计时间，提高审计效率；四是对审计工作进行质量监督并对审计人员的业绩进行考核。
（2）审计工作底稿复核内容。
不同层次复核人的复核重点不同，复核的内容包括；所引用资料是否翔实可靠，是否客现、充分、合法；审计判断是否有理有据，审计结论是否正确。
总之，跟踪审计质量控制是一项系统工程，审计中应严格履行审计程序，搞好审前调查，制定科学、合理、有效的审计方案，采用可行的审计方法。通过完善内部质量控制，对建设期审计项目进行全过程、全方位的质量检查和控制，明确审计人员的职责、权限，合理分工，避免责任相互推诿、漏审等弊病发生。同时，通过跟踪审计及时发现项目建设中存在的管理问题，纠正偏差，加强内部控制，提高项目管理水平，从而提高跟踪审计的工作质量和效率，保证建设项目的质量和进度。