预测环境影响时应尽量选用通用、成熟、简便并能满足准确度要求的方法。目前使用较多的预测方法有：数学模式法、物理模型法、类比分析法和专业判断法等。
1．数学模式法
能给出定量的预测结果，但需一定的计算条件和输入必要的参数、数据。一般情况此方法比较简便，应首先考虑。选用数学模式时要注意模式的应用条件如实际情况不能很好满足模式的应用条件而又拟采用时，要对模式进行修正并验证。
2．物理模型法
定量化程度较高，再现性好，能反映比较复杂的环境特征，但需要有合适的试验条件和必要的基础数据，且制作复杂的环境模型需要较多的人力、物力和时间。在无法利用数学模式法预测而又要求预测结果定量精度较高时，应选用此方法。
3．类比分析法
预测结果属于半定量性质。如由于评价工作时间较短等原因，无法取得足够的参数、数据，不能采用前述两种方法进行预测时，可选用此方法。生态环境影响评价中常用此方法。
4．专业判断法
是定性地反映建设项目的环境影响。建设项目的某些环境影响很难定量估测，如对人文遗迹、自然遗迹与“珍贵”景观的环境影响等，或由于评价时间过短等无法采用以上三种方时可选用此方法，生态影响预测采用的生态机理分析法、景观生态分析法等属此类方法。