招标文件编制问题
我国公路建设具有造价高、周期长、质量要求高、点多、线长、面广、户外作业环境复杂、不可控制因素多等特点。因此在招标文件编制过程容易出现深度不够、不完善等问题。简单套用招标文件范本、FIDIC合同文件范本、未能充分结合项目的水文地质、地理、勘察及本身特点等实际情况;漏洞大，特别是各分项工程量的编制和套价最繁琐、最关键，也最容易产生问题;编制人员在编制过程中经常会出现漏项、数量核对错误或计算错误，对各分部分项工程的项目特征和内容描述不确切、不全面;设计图纸深度不够或存在其他缺陷等。
计价、组价问题
相关定额、费率计取混乱，缺乏时效性，随意性强，不按规范计价，有些分项组价不准确、不完整(有些分部分项工程在定额中并没有与之相对应的选项能套用，如道路工程中，水泥稳定碎石道路基层定额的套取，就没有现成的定额套用)，风险、利润考虑不周全，材料设备价格偏离市场实际，拟定的施工方案不完善等。
招标控制价的设定问题
没有充分考虑市场情况及风险因素，招标控制价设置有问题。如设置太低，甚至低于社会平均先进水平，则难以保证招标质量;设置过高，则造成投标方利润高于正常水平或是简单的按公式套用。
投标人对复核缺乏重视
计价清单规范中规定投标人可对招标控制价进行复核，但由于工程项目工期要求紧、工作量大、投标时间紧迫，投标人没有充裕的时间对招标控制价进行复核，或者即使发现招标控制价尤其是招标工程量有问题，也会利用不平衡报价的方法来获取更高的利润。
备案审查的问题
备案审查走程序、流于形式。有时编制者跟审核者之间的经验能力悬殊太大。审查者的职业技能，职业素质不高，审核资格不够，未能达到最初的审查意愿。
标方只提供招标控制总价，未提供综合单价明细分析表，致使审查单位无法详细审核，并且投标方也无法进行复核。