一、审前准备工作
1、收集工程相关的文件资料。施工合同、招投标文件、编制标底等工程相关文件资料是工程决算编制的指导性文件，在进行工程决算审计工作之前，必须对其进行收集整理，并进行详细地了解。
2、熟悉竣工图纸。竣工图是审计决算分项数量的重要依据，必须全面熟悉了解，核对所有图纸，清点无误后依次识读。
3、了解决算包括的范围。根据决算编制说明，了解决算包括的工程内容。例如配套设施、室外管线、道路以及会审图纸后的设计变更等。
4、弄清所采用的单位估价表。任何单位估价表或预算定额都有一定的适用范围，应根据工程性质，收集熟悉相应的单价、定额资料。
二、建设项目跟踪审计程序及相关要求
1.应在建设项目正式立项时，即将其纳入审计视野，关注其各项前期准备工作。正式进点时间可安排在即将正式开工前。
2.审计组应在项目现场设立办公场所，与被审计单位建立定期例会制度，参加被审计单位的重要例会，及时了解、掌握项目有关情况，提出审计意见，并且作好会议记录。
3.对中标合同价进行控制，不允许施工现场随意变更设计、增项、减项、扩大工程造价;对工程用料，隐蔽工程进行质量和数量监控，防止施工单位偷工减料或以次充好。所有隐蔽工程除应有甲方施工现场管理人员、监理人员签字外，还必须有跟踪审计人员签字。
4.审计组成员应经常深入施工现场，掌握工程进展、变更等真实情况，了解工程建设中涉及的有关技术问题，熟悉工程计量规则及有关费用的测算办法，并且作好相关记录。对各参建单位(包括建设项目相关单位)实际完成的工作内容、工作数量、工作质量进行核定，开具核定单。
5.审计组应根据跟踪审计实施方案的要求，要求被审计单位按照审计组规定的时间和方法报送工程结算资料，并及时确定审计结果：
(1)采用"按实结算"方式的，必须要求施工企业按照已完成的形象进度，及时报送"分部、分项工程"的结算资料，予以审计。在较短的时间内做到"工程施工完成，工程结算审计基本结束";
(2)采用"中标价包干，设计变更、额外工作量签证按实调整"结算方式的，必须要求施工企业每月将已发生的设计变更、签证工作量编制"变更部分结算"，经审计后作为工程竣工结算的组成部分;
(3)采用"单价包干、工程量按实结算"方式的，必须要求施工企业对已完成的形象进度上报"分部、分项工程"的结算资料，经审计后作为工程竣工结算的组成部分;
(4)对于在建工程其他费用的审计，亦应本着"及时、完整、准确"的原则进行审计，并按时做好《审计工作底稿》。
6.审计组应建立《跟踪审计项目台账》，由主审人员负责及时登记审计时间、工作纪实(包括工作内容、审计事实、发现问题、审计意见、整改情况、审计成果)。台帐要注重反映量化成果，成为反映跟踪审计全貌的工作日志。
三、建设项目跟踪审计内容
(一)建设项目开工前阶段，审计的主要内容应包括：
1.审计建设项目的审批文件。包括项目建议书、可行性研究报告、环境影响评估报告、概算批复、建设用地批准、建设规划及施工许可、环保及消防批准、项目设计及设计图审核等文件是否齐全。
2.施工准备阶段是项目建设的前期工作之一，主要把握好项目法人质量控制、监理工作、施工单位选择。项目法人质量控制是否通过资质审查，是否按法定的招投标程序选择了勘测、设计、施工、监理单位并实行合同管理，各种合同是否规范、合法有效，是否建立了质量管理制度，是否组织了设计与施工单位的设计交底;监理单位是否有相应资格等级证书，所派监理人员是否有岗位证书;审计设计单位是否有承担相应资质勘测设计能力，是否将经过会审后的资料做过技术交底，设计质量是否满足工程质量、安全需要的规范要求;审计施工单位是否有承揽相应施工任务的资质，施工单位是否制定了完善的质量责任制考核办法等。
3.审计建设项目的资金来源是否落实到位、是否合理、是否专户存储，建设资金能否满足项目建设当年应完成工作量的需要;各种规费是否按规定及时缴纳;减、缓、免手续是否完备，是否符合有关规定;征地或拆迁补偿费是否符合有关规定，有关评估、计价是否合规、合理，有无擅自扩大拆迁范围、提高标准或者降低标准等问题。
(二)建设项目施工阶段是一个非常关键的时期，关系到工程质量好坏、审计质量高低的问题，审计内容应包括：
1、审计合同履行情况。审计与建设项目有关的单位是否认真履行合同条款，有无违法分包、转包工程。如有变更、增补、转让或终止情况，应检查其真实性、合法性。
2.审计内控制度建立、执行情况。审计建设单位是否建立健全并执行了各项内控制度。如工程签证、验收制度;设备材料采购、价格控制、验收、领用、清点制度;费用支出报销制度等。应督促、指导建立完善的管理制度，保证项目建设规范运行、建设资金合法使用。
3.审计工程设计变更、施工现场签证手续是否合理、合规、及时、完整、真实;工程预算款及结算是否按合同办理;
4.审计工程成本核算及账务处理是否符合《国有建设单位会计制度》的要求，是否有利于建设项目的管理及竣工决算的需要;建设资金到位情况是否与资金筹集计划或投资进度相衔接，有无大量资金闲置、或因资金不到位而造成停工待料等损失浪费现象。
5.检查建设资金是否专款专用;是否按照工程进度付款;有无挤占、挪用建设项目资金等问题;对往来资金数额较大且长时间不结转的预付工程款、预付备料款要查明原因，防止出现超付工程款现象;审计建设单位管理费的计取范围和标准是否符合有关规定，费用支出是否符合"必须、节约"的原则，有无超出概算控制金额的情况。
6.加强设备、材料价格控制，尤其要对建设单位关联企业所供设备、材料的价格进行检查，防止从中加价。对已购设备、材料因故不能使用的，要分析原因，分清责任，并督促建设单位及时处理，避免造成更大的损失。属政府采购的设备、材料是否按相应规定办理。
四、建筑项目竣工决算审计的常用方法
为实现工程决算的快速审查，就要按照从粗到细、对比分析、查找误差、简化审查的原则，对编制的预决算采用对比、逐项筛选和利用统筹法原理迅速匡算等技巧、方法，使审计工作达到事半功倍的实效。
1、全面审计法。是指按照国家或行业建筑工程预算定额的编制顺序或施工的先后顺序，逐一的对全部项目进行审查的方法。其具体计算方法和审查过程与编制施工图预算基本相同：首先，根据竣工图全面计算工程量。然后，将本人计算的工程量与审核对象的工程量一一进行对比。同时，根据定额或单位估价表逐项核实审核对象的单价。此方法的优点是全面、细致，经审计的工程造价差错比较少、质量比较高，审核后的施工图预决算准确度较高。缺点是工作量较大。对于工程量比较小、工艺比较简单、造价编制或报价单位技术力量薄弱，甚至信誉度较低的单位须采用全面审计法。
2、分组计算审计法。把决算中的项目划分为若干组，并把相连且有一定内在联系的项目编为一组，审查或计算同一组中某个分项工程量，利用工程量间具有相同或相似计算基础的关系，判断同组中其他几个分项工程量计算的准确程度的方法。如：
(1)地槽挖土、基础砌体、基础垫层、槽坑回填土、运土。
在该分组中，先将挖地槽土方、基础砌体体积(室外地坪以下部分)、基础垫层计算出来，而槽坑回填土、外运的体积按以下确定：
回填土量=挖土量—(基础砌体+垫层体积)
余土外运量=基础砌体+垫层体积
(2)底层建筑面积、地面面层、地面垫层、楼面面层、楼面找平层、楼板体积、天棚抹灰、天棚刷浆、屋面面层。
在该分组中，先把底层建筑面积、楼(地)面面积计算出来。而楼面找平层、天棚抹灰、刷涂料的工程量与楼(地)面面积相同;垫层工程量等于地面面积乘垫层厚度，空心楼板工程量由楼面工程量乘楼板的折算厚度;底层建筑面积加挑檐面积乘坡度系数(平层面不乘)就是屋面工程量;底层建筑面积乘坡度系数(平层面不乘)再乘保温层的平均厚度为保温层工程量。
(3)内墙外抹灰、外墙内抹灰、外墙内面刷浆、外墙上的门窗和圈过梁、外墙砌体。
在该分组中，首先把各种厚度的内外墙上的门窗面积和过梁体积分别列表填写，再进行工程量计算。先求出内墙面积，再减门窗面积，再乘墙厚减圈过梁体积等于墙体积(如果室内外高差部分与墙体材料不同时，应从墙体中扣除，另行计算)。
3、重点抽查审计法：这种方法类同于全面审计法，其与全面审计法之区别仅是审计范围不同而已。该方法有侧重地，有选择地根据竣工图计算部分价值较高或占投资比例较大的分项工程量。如砖石结构(基础、墙体)、钢筋混凝土结构(梁、板、柱)、木结构(门窗)、钢结构(屋架、檩条、支撑)，以及高级装饰等;而对其他价值较低或占投资比例较小的分项工程，如普通装饰项目、零星项目(雨蓬、散水、坡道、明沟、水池、垃圾箱)等，可忽略不计，重点核实与上述工程量相对应的定额单价，尤其重点审核定额子目档次易混淆的单价(如构件断面、单体体积)，其次是混凝土强度等级、砌筑砂浆、抹灰砂浆的强度等级换算。这种方法与全面审计法比较，工作量相对减少，既可提高工作效率，又能做到准确无误。
4、标准图审计法：是指对于利用标准图纸或通过图纸施工的工程项目，先集中审计力量编制标准预算或决算造价，以此为标准，进行对比审计的方法。按标准图纸设计或通用图纸施工的工程一般地面以上结构相同，可集中审计力量细审一份预决算造价，作为这种标准图纸的标准造价;或用这种标准图纸的工程量为标准，对照审计。而对局部不同的部分和设计变更部分作单独审查即可。这种方法的优点是时间短、效果好、定案容易;缺点是只适用按标准图纸设计或施工的工程，适用范围小。
5、筛选审计法：建筑工程虽然有建筑面积和高度的不同，但是它们的各个分部分项工程的工程量、造价、用工量在每个单位面积上的数值变化不大，我们把过去审计积累的这些数据加以汇集、优选、归纳为工程量、造价(价值)、用工等几个单方基本值表，并注明其适用的建筑标准。这些基本值犹如“筛子孔”，用来筛选各分部分项工程，筛下去的就不予审计了;没有筛下去的就意味着此分部分项的单位建筑面积数值不在基本值范围之内，应对该分部分项工程进行详细审计。此方法的优点是简单易懂、便于掌握，审计速度和发现问题快。适用于住宅工程或不具备全面审计审查条件的工程。
6、分析对比审计法：是指用已经审计的工程造价同拟审类似工程进行对比审计的方法。这种方法一般应根据工程的不同条件和特点区别对待。一是两工程采用同一个施工图，但基础部分和现场条件及变更不尽相同。其拟审计工程基础以上部分可采用对比审计法;不同部分可分别计算或采用相应的审计方法进行审计。二是两个工程设计相同，但建筑面积不同。可根据两个工程建筑面积之比与两个工程分部分项工程量之比例基本一致的特点，将两个工程每平方米建筑面积造价以及每平方米建筑面积的各分部分项工程量进行对比审查。如果基本相同时，说明拟审计工程造价是正确的，或拟审计的分部分项工程量是正确的。反之，说明拟审造价存在问题，应找出差错原因，加以更正。三是拟审工程与已审工程的面积相同，但设计图纸不完全相同时，可把相同部分，如厂房中的柱子、房架、屋面、砖墙等进行工程量的对比审计，不能对比的分部分项工程按图纸或签证计算。在总结分析工程决算资料的基础上，找出同类工程造价及工料消耗的规律性，整理出结构形式不同、地区不同的工程造价、工料消耗指标。然后，根据这些指标对审核对象进行分析对比，从中找出不符合投资规律的分部分项工程，针对这些子目再进行重点审计，分析其差异较大的原因。常用指标有以下几种类型：
(1)单方造价指标(元/m3、元/m2、元/m等);
(2)分部工程比例：基础、楼板屋面、门窗、围护结构等各占定额直接费的比例;
(3)各种结构比例：砖石、混凝土及钢筋混凝土、木结构、金属结构、装饰、土石方等各占定额直接费的比例：
(4)专业投资比例：土建、给排水、采暖通风、电气照明等各专业占总造价的比例;
(5)工料消耗指标：即钢材、木材、水泥、砂、石、砖、瓦、人工等主要工料的单方消耗指标。