屋顶绿化采用的植物应优先选择具有耐瘠、喜阳、树冠饱满、枝干壮实、生长速度偏慢或适中、根系横向发达等特性的树种。如金虹桥国际中心屋顶绿化项目中采用的大、小乔木品种有：香樟、银杏、朴树、乌桕、无患子、女贞、白蜡、三角枫、香橼、红梅、桂花、紫荆、红枫、鸡爪槭、北美枫香、晚樱、羽毛枫、杨梅、石榴、丹桂、紫薇、罗汉松等。屋顶绿化上使用的苗木的栽植部位都处于屋顶层面。一旦施工完毕后如果出现问题，更换十分困难。所以，在具体项目实施时，应充分考虑到大小乔木栽植在屋顶花园区域内的土壤层的厚度以及施工场地的客观限制，继而应对苗木的来源地、健壮度必须予以足够的关注。
在选择屋顶绿化项目的苗源基地时，选择已具有横生根系且生长茁壮的苗木。在确认苗源时，不仅要看苗木的胸径、冠幅、苗姿，还要注意苗木的树干是否健康。选择大乔木，必须在近年内经历过两次移栽且生长势良好、根系复壮萌动能力相对较强、须根发达、无病虫害侵蚀迹象的“盆栽苗”。