毕业论文的写作，如果仅仅注重内容的正确与深刻、结构的严谨与完整，而忽视了行文的格式，结果文章逻辑混乱、别字甚多、标点乱用，不免让人贻笑大方，这样的论文也是不合格的论文。这是高等学校学生毕业论文写作中存在较多的问题。
毕业论文的行文决不是“无碍大体的细枝末节”，它是大学生良好的写作素养的表现，也是其科研素养的基本构成要素。大学生在行文格式书写方面必须养成良好的习惯。
1、毕业论文行文的逻辑要领
增强毕业论文行文的逻辑力量，达到概念明确，论证充分，条理分明，思路畅通，是写好毕业论文的关键。提高毕业论文行文的逻辑性，需把握以下几点：
(l)要思路畅通，纲举目张
写毕业论文时，思维必须具有清晰性、连贯性、周密性、条理性和规律性，才能构建起严谨、和谐的逻辑结构。同时还要纲举目张，即首先要举其"纲"，即要有中心论点，以统帅各分论点;二是张其"目"，即要有一个确定的思路，贯穿各个分论点，决定论述沿什么途径展开;三要纲目结合，即纲举目张，清楚地分出各个论点并列的或从属的关系，分出亲疏远近，以便有秩序、有层次、有步骤地表现中心论点。只有做到了这一点，才能使论文得到一个恰当的布局、组织和安排。在这里，中心论点起着决定性作用，它是论文的灵魂和统帅。任何论文，都不能离开一定的议题，一定的视角，一定的实践要求，把各种问题东拼西凑在一起，而只能按照中心论点的要求，把整篇文章的各个论点，有机地组织起来，做到“挚领而顿”，“首尾皆顺”。
(2)要层次清晰，有条有理
写毕业论文，先说什么，后说什么，一层一层如何衔接，这一点和论文行文的逻辑性很有关系。对于文章中的大小论点，一定要分类排队，科学地安排层次(包括问题自身的层次、说法上的层次和做法上的层次)。如果由A问题会产生B问题，A问题就应在先，B问题在后，这里就有客观上问题自身的层次;如果A问题不解决，B问题就不能解决，这里就有解决问题的做法上的层次;不先说清A问题就不能说清B问题，这里就有问题说法上的层次。可见，层次是一种有机联系，而非形式的、人为的联系。因此，论述中特别要注意事物本身的层次，或议论的问题自身矛盾发展的层次。要做到这点，就要熟悉事物，分析问题之间的联系，而不能单纯凭主观去臆定层次。找到了问题的层次，议论也就有了条理。能层次分明，也就能有条不紊。如果只注意条理，却搞不清层次，那也不行。总之，要根据正确的思维规律，把要表达的思想恰当地排列，以便正确地反映客观上存在的秩序，以避免行文中的“颠三倒四”、“语无伦次”、“主次不分”。
一般来说，毕业论文行文的顺序应当符合事实发展的顺序，符合人们认识的程序和规律，如前提与结论、原因与结果、主体与从属、现象与本质等各种关系的顺序。一篇毕业论文的行文顺序，虽然也有变化的形态，如倒叙、插叙等，但只要按事物本身的层次来展开论述，不管怎样变化，正常的顺序就一定能交代清楚。
(3)要论证充分，以理服人
写毕业论文，最常用的方法是归纳论证，即用对事实的科学分析和叙述来证明观点，或用基本的史实、科学的调查、精确的数字来证明观点。它体现的主要是客观逻辑的力量，事实胜于雄辩，就是这个意思。如果没有大量的、可靠的、令人信服的事实材料，或者缺乏科学的归纳，甚至没有归纳就作分析，还有的先立结论，然后去找例证，那么结论常常是不可靠的。因为归纳是从个别到一般，个别的东西越多，归纳得愈合理、科学，你的结论就越可靠。要使论证逻辑上有力，就得把那些对导致结论有重大关系的论据之间的关系、联系讲清楚说明白。这就要坚持具体事物具体分析的原则。不分析事物，或分析不到家，不在行，就既不会找全论据，也不会看出论据间的辩证关系。那么，在论证事物时，就不可能论证得好，不可能论证得有力。论证要服人，有时还得去说明论据的真实可靠，即论证论据。论证论题的方法很多，但根本的是要找出论据的客观来路。另外，为增加论据的信服度，将不同的或对立的论据加以对比说明，也不失为一个好方法。
(4)要首尾一贯，明白确切
毕业论文行文要注意思维和论述首尾一贯，明白确切。即：论述要概念明白，立场鲜明，前后不发生矛盾，讲清主张什么，反对什么，尤其是要注意论文的一贯性和确切性。一贯性一般表现为：前有问题，后有答案;前有伏笔，后有发挥。有些论点，经过很多论证和解释，再同另一论点联系、照应。既使它们在论文中相距较远，也要使它们有线相连，能够互送“秋波”。一般的连续和照应，并不困难，比较困难的情况是，由一个思想过渡到另一个思想，由一个角度和侧面转换到另一个角度和侧面。碰到这种情况，就要特别注意，努力保持联系的线索，避免造成脱节。有时为保持联系线索的明确和连续性，还要明白交代联系的媒介。在论文中，有些段落，就是专为交代媒介、交代层次以便转换和过渡来服务的。特别是对中间环节较多的联系，一定不能简单地抽掉其中复杂的判断和推理关系，来一个急转直下，使读者感到突兀和摸不着头脑。拿论题和论据来说，要使它们之间联系，就要在复杂的情况下，进行一系列的论证，暴露它们之间的复杂的推理关系，而不能简单地抽空去掉其中的论证过程，只把根据或结论塞给读者。
要善于运用结尾来发挥作用;或在结尾再作出综合小结，重申要点;或回过头来扣紧开头，强调意义;或概括全篇的大意，点明主题;或引出新的论点，启发读者的思想。这种首尾的连续，其实质也是保持中心论点的一贯性和确定性。
2、毕业论文行文的格式要领
(1)、文字书写应工整、规范，语言准确、简洁、严密
语言文字是论文的"第一信号系统"，担负着表达论文内容的重任，直接关系着论文的写作质量。为此，论文书写应工整清楚，也就是书写要便于识别。特别要注意一些容易混淆的偏旁部首的写法。规范，也就是要按照国家颁布的《简化字总表》写字，不用不规范的简化字，不要自造字。现在，自造和使用不规范的简化字的现象比较普遍。近些年大学生用计算机打印论文已很普遍，其工整性无可挑剔，但错别字异常之多，究其原因或是手稿不够工整，打字者不易识别;或本身错别字连篇，校对时没有耐心，不够仔细，有时甚至一字之差，则谬之千里。杜绝错别字并不困难，只要勤查字典就可避免。
另外，论文用语要准确、简洁、通顺、严密。准确，就是论文的语言要确切、鲜明地表达观点;用词要精确，恰到好处，做到词意相符。简洁，就是行文要言简意赅，不必过分修饰，力避冗长。严密，是指判断要恰当，推理要正确，论证要明确，行文要前后关照。
(2)、标点符号的写法与使用
标点符号是论文中仅次于语言文字的"第二信号系统"，具有精确地表达论文的主要论点的重要作用。标点符号的使用不仅能使文章表达顺畅，而且还具有突出的修辞作用。
标点要点在格内。句号、逗号、顿号、分号、冒号等书写时应占一格;引号、括号、书名号，原则上两端均应占一格;省略号、破折号，均应占两格;引号和括号经常要和其他标点符号一起用，书写时可各占1/2位置。引号、括号、书名号的前一部分遇到回行时，不得孤立地写在文末，应在行末带上一字，或将它们移到下一行的开头。引号、括号、书名号的后一部分，不能用在每一行的第一格。遇到回行情况时，一定要尾随文后，占文未框线的近处。省略号、破折号不能折成两行写。标点符号使用中需注意的问题有：
①问号的使用
问号是句末的停顿，不能用在句中。有些句子虽然含有疑问代词属于疑问格式，但整个句子不是提问语气，并不要求回答，就不能用问号。如："为什么会出现这种现象?这是个值得深入研究的问题。"这个句子中间的停顿不应该用问号，应改为逗号。
②引号的使用
引号里引用的话必须原文照录，不能擅自改动;如果引用的只是原文的大意，则不必加引号。引号里的引文是完整的照录，那么引文最后的标点符号应放在引文之内;如果引文只断引了一个片断或几个字，那么标点符号应放在引号之外。在双引号和单引号重用时，其规范是：运用双引号，双引号内又有引文则用单引号;如果单引号内又有引文，那就再用双引号。格式为：“”"……"。
(3)引文的方式和书写格式
写毕业论文时经常会援引经典文献或他人著作和文章中的材料、言论、观点。
①引文的方式。引文的方式大致有三种：一种是整段原文的引用;一种是摘引;一种是转述。采取摘引的方式，有种种原因或者因原文大长，没有必要整段引用，只需摘引其中几句;或者由于原文句式比较复杂，语言不够通俗，采用摘引的方式，把原文拆开安插在自己的文句中，用自己的语句结构、语气把它们连接起来。采用转述的方法，主要是为了使引文简短些。也有的是为了使所引内容的文字风格和自己的论文风格用快调。
②引文的书写格式。主要有段中引文和提行引文两种。较短而又不太重要的引文，一般都随行文引用。若引用的是原话，一定要核对准确，并需加前后双引号;若引的不是原文，只是原意，那么文前只用冒号，或用返兮，不加引号;比较完整的引文，或者内容重要，或者需要强调的引文，要提行，独立成段，在冒号后另起一段。为区别正常的行文，书写时前头缩进两格(相对于正文需缩进四格);;提行引文的头尾处不必再加引号，上下可不必空行。
(4)图表的运用
图表是指用图形和表格的方式，记录和传达某种内容。在毕业论文的写作中适当地运用图表能起到同文字一样的表达功能。好的图形，如结构图、统计图、示意图等能够表达难以用文字表达的材料，使人一目了然，起到直观的作用。图表的制作要仔细挑选材料，尽量准确无误、简明易懂，美观、大方、清晰。
(5)附注