区域生态安全格局研究关注区域尺度的生态环境问题、格局与过程的关系、等级尺度问题、干扰的影响、生物多样性保护、生态系统恢复、以及社会经济发展等，并强调这些方面的综合集成，因此其理论基础涉及景观生态学（格局与过程的相互作用）、干扰生态学（干扰与格局的相互作用）、保护生物学（生物多样性保护）、恢复生态学（生态系统结构和功能恢复）、生态经济学（自然资源保护性利用）、生态伦理学（人与自然和谐）和复合生态系统理论（整体观）等多个学科的内容，这些学科领域的成果为区域生态安全格局研究提供了有益借鉴。
区域生态安全格局研究关注区域尺度的生态环境问题、格局与过程的关系、等级尺度问题、干扰的影响、生物多样性保护、生态系统恢复、以及社会经济发展等，并强调这些方面的综合集成，因此其理论基础涉及景观生态学（格局与过程的相互作用）、干扰生态学（干扰与格局的相互作用）、保护生物学（生物多样性保护）、恢复生态学（生态系统结构和功能恢复）、生态经济学（自然资源保护性利用）、生态伦理学（人与自然和谐）和复合生态系统理论（整体观）等多个学科的内容，这些学科领域的成果为区域生态安全格局研究提供了有益借鉴。