1加强监管和审核，提高工程质量
在现代农业发展的大背景下，农田水利工程建设中应该成立专门的监管部门，统一规范招标、工程建设、工程验收标准。在施工过程中，监管部门要进行抽查，对于不合格的工程及时勒令停止，保证施工的质量，并要求相关工程建设完善后进行验收报告，将工程质量与对施工单位的考核挂钩，进行有效监管机制的构建和实施，提高工程质量。在工程审批的过程中，相关部门要完善审批制度，从源头上进行资源的合理利用和工程的保质保量完成，提前规划审核好施工的地址、修渠排水等工程建设情况等，聘任一些专业人才对参与工程建设单位的资质、权利、质量状况进行严格的审核。成立专门的招标部门，设立规范的招标标准和规范，通过公平公正的方式进行合理竞标，避免不规范和没资质的单位介入，并设立专门的监督人员，保证工程质量。
2加强管理，明确产权，落实责任
针对目前的农田水利工程，应明确工程设计及施工标准，在权责和利益方面应明确使用者、所有者的不同和直接关系，明确地管理制度，避免出现无人负责的状况，将责、权、利相统一。针对小型的集体所有的水利设施设定专门的管理人负责，对于使用人员进行严格的管理，并明确使用者的责任，出现问题时由使用者负责并追求专门管理人员的责任；针对经济效益较高的工程，通过拍卖、承包、租赁等方式来选择专门的承包商，通过以上方式将产权进行转让并促使其产生经济效益，出现问题有承包商自行负责维护并由工程主管部门进行监督，充分调动农民的积极性与主动性来进行水田水利设施的维护和建设。对于正在建设中的农田水利工程要成立专门的领导小组，对于工程建设问题和施工中的问题进行解决，并设立专门负责的小组组长，明确施工单位和施工人员的责任，并进行县乡村三级责任机制的建立，将具体的责任落实到相关部门的相关人员身上，负责人要根据工程进度进行跟踪汇报，出现问题追求责任人、施工单位、相关部门负责人的责任，避免相互推诿责任的现象。
3加强资金投入和相关人员培训
资金是保证农田水利工程建设的一个重要基础，要鼓励民间资本的介入，设立专门的市场筹集、农民集资、国家及地方政府补贴制度，通过三方的协作建立多层次、多渠道的资金投入机制，通过政策指引和规范进行农田水利基础设施的建设。并且要将此种款项纳入财政预算的范畴之内，保证资金及时足额安排到位并保证专款专用，设立专门的监督小组来避免挪为他用现象的发生。针对农民和相关水利工作者进行技能培训，通过知识讲座、技能培训班、再教育等形式让他们了解最新的国家政策、农业生产技术、维护保养技术、新设备配套技术等，提高他们的工程设计、施工、工程维护等整体素质，让他们及时地适应新时代、新技术的要求，对老水利工程进行合理的维护使用，对新水利工程进行有效地管理建设，保证农田水利工程的良性循环和对新技术的吸纳能力。