随着生物发酵行业的迅速发展和生产规模的迅速扩张，生物发酵废水的环境污染问题越来越突出，由于发酵废液量大，生物发酵废水处理难度和处理成本高，难以采用喷雾干燥等传统干燥方式进行处理以实现资源化回收利用，通常采用高温转筒造粒机制作生物复合肥，或者作为工业废水采取末端治理技术进行污水处理，甚至直接排入大海和江河中，造成严重的环境危害、资源浪费和生产成本的提高。因此，废水污染已成为发酵工业进一步发展的限制性因素。
生物发酵废水处理工艺以赖氨酸、苏氨酸和色氨酸为例，当用作动物饲料添加剂时，有时没有必要进行精制提纯，如果将粗发酵液，或者将粗发酵液与精制过程中产生的发酵废液的调配液直接浓缩、干燥制得较低有效成分含量的饲料添加剂，则可以彻底避免废液产生，实现发酵废液的近零排放，大大降低对环境的负面影响，同时将发酵副产物中的营养物质全部回收利用。
如果将大型连续流化床造粒干燥成套技术用于谷氨酸发酵废液(味精废液)的造粒干燥制取有机复合肥，由于全部的干燥过程均在低温条件下完成，干燥尾气无污染，避免了传统的高温转筒造粒机所产生的二次空气污染的难题。