水库除险加固工程从前期工作到项目实施是一个较长的过程，从前期设计到投入使用中都必须高度重视施工过程中常见问题的预防和解决，从每一个细节出发，这样才能够更好的保障水库的除险加固。
1、设计上
在工程初步设计阶段，设计单位首先必须对要实施的加固工程进行实地考察，制定切合实际、行之有效的设计方案，这将有利于规避工程实施阶段中可能出现的一系列问题，做好科学的设计、施工方案。
2、材料上
料场的选择与开采是水库除险加固施工管理组织设计的重要环节。在水库除险加固施工管理中，料场的选择与开采，主要包括筑坝土料和砼骨料。在选择筑坝土料时，有必要对土料储量和质量进行勘察分析。施工导流方式选择对水库除险加固施工管理组织设计。为了使水工建筑物能保持在干地上施工，选用恰当的施工导流方式必不可少，一般来说，施工导流方法分为全段围堰法和分段围堰法两种。
3、施工上
注重选择符合实际的施工技术和方法，不同的水库除险加固工程，应当采取不同的施工技术和方法，只有施工技术和方法得当，才能避免出现问题，增容扩效改造都是在原来的机组设备上改造，不破坏水工建筑物方面，不影响机组的强度和稳定性。我们要根据病险水库、水闸的问题和原因，充分考虑新材料、新工艺和新技术的应用，对于工程等级、防洪标准及设计流量不满足要求但主体结构基本完好的水闸，尽量考虑保留原闸室，按规划批复的工程规模及设计水位，通过加高或增扩闸孔来提高过流能力，其余附属设施相应进行加固改造。
4、技术上
GIS水库管理信息系统是特殊的管理系统，以地图数据作为基础二维数据的信息，为管理者及时快速的查询和提取自己需要的信息内容这种管理系统改变了我国传统水利部门的工作管理方式，提高了工作效率，为政府决策部门及工程施工技术人员提供更详细的项目信息，准确了解项目周边环境，对水库的开发和利用，做出更准确合理的决策与规划。
5、监测上
水库大坝控制运用时管理人员的方便性、安全性，设备的可靠性，工作场所的舒适性都需要考虑。通过加固改造，是否减轻了管理人员的劳动强度，自动化监控实现的程度及其有效性，各病险水库是否根据实际情况制订了应急预案，防汛公路运行通畅是否得到保证，管理设施是否先进等。加固改造后维修的方便程度、维修空间、场所是否足够、拆卸吊装方案是否更简便易行且安全可靠。对于水库大坝的维修环境，应能得到明显改善。对大坝和附属建筑物，以及水库安全所必需的相关设备，在尽量保留原有监测设备的基础上，应按要求新增监测设备并使其处于安全和完整的工作状态。对于那些因为除险加固而必须拆除的原有监测设备，从而导致多年监测资料中断，应在被破坏之前，安装过渡性测点，延续监测资料。病险水库一般应有以下安全监测项目：表面变形、渗流量、上下游水位、降雨量、泄流量、放水量等观测设施。
6、验收上
监理部门必须负起责任来，对水库除险加固工程进行严格的检查，检查其资料是否真实和齐全;监理部门还要对水库除险加固工程竣工后的配套系统进行试运行，并且要由专业人员进场开展检查验收工作，对于发现的问题，哪怕是十分微小的问题，也要及时进行解决。建设单位同样要高度重视水库除险加固工程的验收，由专业公司的专业人员进行全面检查，确保没有任何问题方可投入运行，只有这样才能保证水库除险加固工程施工质量。